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醫(yī)學統(tǒng)計學-教案:第六章 方差分析

醫(yī)學統(tǒng)計學:教案 第六章 方差分析:南方醫(yī)科大學教案首頁授課題目方差分析1和2授課形式講授授課時間2006-10-12和10-16授課學時6教學目的與要求1.熟悉方差分析的基本思想及其適用條件;2.掌握完全隨機設計、完全區(qū)組設計資料的方差分析及多個樣本均數(shù)間的兩兩比較:LSD-t檢驗、Dunn

南方醫(yī)科大學教案首頁

授課題目

方差分析1和2

授課形式

講授

授課時間

2006-10-12和10-16

授課學時

6

教學目的

與 要 求

1.  熟悉方差分析的基本思想及其適用條件;

2.  掌握完全隨機設計、完全區(qū)組設計資料的方差分析及多個樣本均數(shù)間的兩兩比較:LSD-t檢驗、Dunnett-t檢驗、SNK-q檢驗;

了解多組樣本的方差齊性檢驗。

基本內容

1.方差分析的基本思想及適用條件

2.完全隨機設計的單因素方差分析

1) 成組設計方差分析中變異的分解

2) 分析計算步驟

3.隨機區(qū)組設計的兩因素方差分析

1) 隨機區(qū)組設計方差分析中變異的分解

2) 分析計算步驟

4.多個樣本均數(shù)間的多重比較

1) LSD-t檢驗

2) Dunnett-t檢驗

3) SNK-q檢驗

5.了解多組樣本的方差齊性檢驗

重 點

難 點

1(重點、難點)方差分析的基本思想:數(shù)據(jù)的總變異(總離均差平方和)按設計和需要分解成兩個或多個組成部分,總自由度也相應分解

2(重點、難點)完全隨機設計、隨機區(qū)組設計、析因設計、重復測量資料方差分析中總變異、自由度的分解

3 主效應、單獨效應、交互效應的概念,如何分析交互效應

4 介紹SNK、Dunnett、Bonfferoni等多重比較方法

5 方差分析的前提條件(正態(tài)性、方差齊),不符合條件時可以做數(shù)據(jù)變換、非參數(shù)統(tǒng)計方法或采用近似檢驗

主要教學

媒 體

多媒體投影儀

主 要 外

語 詞 匯

ANOVA

有關本內容的新進展

主要參考資料或相關網(wǎng)站

http://www.smmu.edu。cn/zykj/~statistics/index/index.htm

1. 徐勇勇主編. 醫(yī)學統(tǒng)計學(第二版). 北京:高等教育出版社,2004

2. 楊樹勤主編. 衛(wèi)生統(tǒng)計學(第二版). 北京:人民衛(wèi)生出版社,1991

3. 方積乾主編. 醫(yī)學統(tǒng)計學與電腦實驗(第二版). 上海:上?茖W技術出版社,2001

4. 孫振球主編. 醫(yī)學統(tǒng)計學(供研究生用). 北京:人民衛(wèi)生出版社,2004

系、教研室

審查意見

課后體會

南方醫(yī)科大學教案

教學內容

時間分配和

媒體選擇

第一部分

第一節(jié) 方差分析的基本思想

1、方差分析的意義

2、方差分析的基本思想

3、方差分析的計算方法

4、方差分析的應用條件與用途

第二節(jié) 完全隨機設計的單因素方差分析(one-way ANOVA)

1、用途:

2、計算公式:

3、分析步驟(以例說明):

第二部分

第三節(jié) 隨機區(qū)組設計的兩因素方差分析(two-way ANOVA)

1、用途:

2、計算公式:

3、分析步驟(以例說明):

第四節(jié) 多個樣本均數(shù)間的多重比較

1、Newman-Keuls檢驗

2、最小顯著差(LSD)t檢驗

小結

80分鐘

40分鐘

40分鐘

40分鐘

40分鐘

 

講稿

教學內容

時間分配

媒體選擇

一、方差分析的用途及應用條件

(一)用途

 1、檢驗兩個或多個樣本均數(shù)間的差異有無統(tǒng)計學意義;

 2、回歸方程的線性假設檢驗;

 3、檢驗兩個或多個因素間有無交互作用。

(二)應用條件

 1、各個樣本是相互獨立的隨機樣本;

 2、各個樣本來自正態(tài)總體;

 3、各個處理組(樣本)的總體方差方差相等,即方差齊。

二、 方差分析的基本思想

(一)方差分析中變異的分解

   此類資料的變異,可以分出三種

   1、總變異:表現(xiàn)為所有數(shù)據(jù)大小不等,用總的離均差平方和表示,記為SS。

  (i 代表第i個組, j代表第j個觀察值)

的大小還與總例數(shù)N有關,確切講是與總的自由度有關,  =N-1。

  2、組間變異:組間變異表現(xiàn)為各組均數(shù)大小不等,描述其大小指標

1)用各組均數(shù)與總均數(shù)X的離均差平方和表示,記為SS組間,SS組間的大小與處理因素的作 用、隨機誤差(測量誤差和個體差異)和組間自由度有關。

    ,

2)用SS組間 除于組間自由度表示,稱組間均方

    組間均方反映處理因素和隨機誤差的作用。

3、組內變異:組內變異表現(xiàn)為各組內部各個觀察值大小不等。描述其大小指標:

1)用各組內部每個觀察值與組均數(shù)X的離均差平方和表示,記為SS組內。SS組內的大小與隨機誤差(測量誤差和個體差異)和組內自由度有關。

  ,

2)用SS組內除于組內自由度表示,稱組內均方

 

    組內均方只反映觀察值的隨機誤差(個體差異及隨機測量誤差)。

三種變異的關系:

SS=SS組內+SS組間 , 

(二)方差分析思想

 1、如果兩個或多個樣本來自同一個總體,或者處理因素的效應一樣(沒有差異),則組間和組內的變異相等,即:

MS組間 =MS組內

或兩者相差不大,它們的比值用F表示:

 

F=1, F1相差不大。

2、若兩個樣本或多個樣本來自不同總體,或者處理因素的效應不一樣,則組間變異大于組內變異,即:

MS組間>MS組內

   F值明顯大于1。要大到多大程度才有統(tǒng)計學意義?查F界值表,由F值確定P值,按P值大小作出推斷。

方差分析基本思想:在方差分析時,根據(jù)資料的設計類型不同,將總的離均差平方和及自由度分解為兩個或多個部分,除隨機誤差外,其余部分的變異反映處理因素的作用,通過比較不同來源的均方,借助F分布原理作出統(tǒng)計推斷,從而了解處理因素對觀測指標有無影響。

三、單因素方差分析

(一)計算方法

   單因素方差分析的計算公式

變異來源  SS  υ MS   F

組間   k-1    

組內(誤差) SS - SS組間   N-k    

總     N-1

會計資格*

四、分析步驟

  1、建立假設和確定檢驗水準;

  H0:

  H1: 不等或不全相等

 

  2、計算檢驗統(tǒng)計量F

表9-15  例9-16 方差分析結果

變異來源  SS   υ    MS     F    P

組間    2.0276 3   0.6759 10.24 <0.01

組內    0.7918   12

 總     2.8194   15

 3、確定P值和推斷結論

   以組間自由度,以組內自由度,查附表3F界值表:=3.49,由于, P<0.05; ,拒絕H0,接受H1, 可以認為四組均數(shù)不等或不全相等。

   注意:以上僅是總的結論,尚需對四個樣本均數(shù)進行兩兩比較(見后)。

五、 多個樣本均數(shù)的兩兩比較-q檢驗

多個樣本均數(shù)比較經(jīng)F檢驗后,若得出有統(tǒng)計學意義的結論后,要進一步推斷哪些組之間有差別,哪些組之間沒有差別,還是所有各組之間都有差別,要解決這些問題,就要進一步做均數(shù)間的兩兩比較了。

多個樣本均數(shù)間的兩兩比較又稱多重比較,由于涉及的對比組數(shù)大于2,就不能應用前面介紹的t檢驗,只能使用下面介紹的方法。 若仍用前述前述的t檢驗方法,對每兩個對比組作比較,會使犯第一類錯誤(拒絕了實際上成立的H0所犯的錯誤)的概率α增大,即可能把本來無差別的兩個總體均數(shù)判為有差別。

(一)檢驗統(tǒng)計量q的計算公式為:

 

式中  為兩個對比組的樣本均數(shù)。為方差分析中算得的組內均方), 分別為兩對比組的樣本例數(shù)。q檢驗適用于多個均數(shù)間的兩兩比較。

 (二) q檢驗的方法步驟

  對例9-16資料作兩兩比較。

1、建立假設

    H0:任兩對比組的總體均數(shù)相等,即

    H1:任兩對比組的總體均數(shù)不等,

2、選擇檢驗方法,計算統(tǒng)計量q

  

 

 

將四個樣本均數(shù)從大到小順序排列,并編上組次:

   組次  1   2    中國衛(wèi)生人才網(wǎng)3 4

   均數(shù) 3.3200 3.0975 2.6850   2.4025

   組別   D   C   B  A

    

列出兩兩比較計算表,見表9-17

   表9-17 四個樣本均數(shù)兩兩比較的q檢驗

對比組 兩均數(shù)之差 標準誤   q值 組數(shù) q界值 P

A與B    a     0.05   0.01

(1)   (2)   (3)   (4)=(2)/(3) (5)  (6)    (7)   (8)

1與4 0.9175   0.1285  7.140  4  4.20 5.50 <0.01

1與3 0.6350   0.1285  4.942  3  3.77 5.05 <0.05

1與2 0.2225   0.1285  1.732  2  3.08 4.32 >0.05

2與4 0.6950   0.1285  5.409  3  3.77 5.05 <0.01

2與3 0.4125   0.1285  3.210  2  3.08 4.32 <0.05

3與4 0.2825   0.1285  2.198  2  3.08 4.32 >0.05

3、確定P值,判斷結果

   由表9-17中第8欄可以知道,除了第1組與第2組以及第3組與第4組之間差別沒有顯著性外,其他組間差別均有顯著性差異。

六、LSD-t檢驗(最小顯著差異t檢驗,Least significant difference)

LSD-t檢驗適用于某一對或幾對在專業(yè)上有特殊價值的均數(shù)間的比較。

統(tǒng)計量計算公式為:

七、Dunnett-t檢驗

Dunnett-t檢驗適用于k-1個實驗組與一個對照組均數(shù)差別的多重比較。

統(tǒng)計量計算公式為:

幾種方法的敏感性比較:LSD>Dunnett>SNK>Tukey>Scheff。

八、隨機區(qū)組設計/配伍組設計資料的方差分析(two-way ANOVA)

1、隨機區(qū)組設計

相當于配對設計的擴大。具體做法是將受試對象按性質相同或相近者組成b個單位組(配伍組),每個單位組中有k個受試對象,分別隨機地分配到k個處理組。這種設計使得各處理組受試對象數(shù)量相同,生物學特點也較為均衡。由于減少了誤差,試驗效率提高了。

例A:為研究注射不同劑量雌激素對大白鼠子宮重量的影響,取4窩不同種系的大白鼠(b=4),每窩3只,隨機地分配到3個組內(k=3)接受不同劑量的雌激素的注射,然后測定其子宮重量,問注射不同劑量的雌激素對大白鼠子宮重量是否有影響?

解:

1.   建立假設、確定檢驗水準

 H0m1= m2= m3雌激素對大白子宮重量無影響

 H1m1m2、 m3不相等或 不全相等

 a=0.01

2.   計算檢驗統(tǒng)計量F

隨機區(qū)組設計的方差分析表

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3.   確定P 值、下結論

Ø   處理間差別的推斷:v處理 = 2,v誤差 = 6,查表得F 0.01,2,6=10.92,因P <0.01,按a =0.01水準拒絕H0,故可認為三個劑量組對大白鼠子宮重量有影響。

Ø   配伍組間差別推斷:F0.01,3,6=9.78,配伍組間P<0.01,按a=0.01水準拒絕H0,故認為各配伍組間的總體均數(shù)有差別。此設計將配伍組間變異從組內變異中分解出來,減少了誤差,較之完全隨機設計,試驗效率提高了。

Ø 如果F配伍<1 , MS配伍<MS誤差 ,配伍設計無效(或曰無必要進行配伍設計);

Ø 應將SS配伍SS誤差合并, v配伍v誤差合并,計算出新的MS誤差’,并計算新的F值,再查F 界值表,下結論。

   F處理=MS處理/MS誤差

   F處理’= MS處理/ MS誤差

九、小結

ANOVA的基本思想

完全隨機設計和配伍組設計的不同

各變異間的關系

常用的均數(shù)間兩兩比較的方法

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