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Nature Biotech：解碼中國(guó)倉(cāng)鼠基因組
在Alfred Pühler教授的領(lǐng)導(dǎo)下，來(lái)自比勒菲爾德大學(xué)生物技術(shù)中心(CeBiTec)的基因組研究人員，成功地對(duì)中國(guó)倉(cāng)鼠（Chinese hamster)的基因組進(jìn)行了測(cè)序。研究人員現(xiàn)將他們的結(jié)果發(fā)表了在國(guó)際期刊《自然生物技術(shù)》（Nature Biotechnology)雜志上。
CeBiTec科學(xué)主任Thomas Noll相信，他們獲得的數(shù)據(jù)將引起科學(xué)和工業(yè)團(tuán)體的興趣。制藥行業(yè)一直利用來(lái)自中國(guó)倉(cāng)鼠的細(xì)胞培養(yǎng)物來(lái)生成諸如醫(yī)用抗體等生物藥品�！霸谖磥�(lái)，解碼的倉(cāng)鼠基因組將大大推動(dòng)利用這些細(xì)胞系來(lái)生產(chǎn)藥物制劑，”Noll說(shuō)。
中國(guó)倉(cāng)鼠基因組包含11對(duì)染色體。解碼這樣的大型基因組需要生成大的數(shù)據(jù)集，然后利用生物信息學(xué)對(duì)其進(jìn)行處理。為了更容易地分析生成的數(shù)據(jù)，比勒菲爾德大學(xué)的研究人員和他們的同事，應(yīng)用了一種全新的程序來(lái)對(duì)基因組單條染色體進(jìn)行分類。CeBiTe的Karina Brinkrolf博士完成了對(duì)倉(cāng)鼠染色體的測(cè)序。在新一代測(cè)序儀器的幫助下生成了超過(guò)14億短DNA序列醫(yī).學(xué)全.在.線網(wǎng)站52667788.cnNature Biotech：解碼中國(guó)倉(cāng)鼠基因組。
該項(xiàng)目的領(lǐng)導(dǎo)者Alfred Pühler教授說(shuō)：“這一項(xiàng)目的主要挑戰(zhàn)是隨后將這些短DNA序列拼接在一起，形成一條總的染色體序列�！边@項(xiàng)工作只能用功能強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)來(lái)完成。該項(xiàng)目的參與者、生物信息學(xué)專家Alexander Goesmann博士說(shuō)：“我們必須完成新的CeBiTec計(jì)算機(jī)集群，應(yīng)用新軟件才能確定這一基因組序列。通過(guò)解碼倉(cāng)鼠基因組序列，比勒菲爾德大學(xué)的生物信息學(xué)取得了新的突破。”具有大約23億個(gè)堿基，中國(guó)倉(cāng)鼠基因組序列的大小可與人類基因組媲美。
Alfred Pühler認(rèn)為這項(xiàng)研究是CeBiTec研究工作的一項(xiàng)里程碑：“解碼這一倉(cāng)鼠基因組標(biāo)志著一項(xiàng)重要的CeBiTec計(jì)劃成功地完成。這一倉(cāng)鼠序列可在公共領(lǐng)域獲得，供全世界研究利用�！边@一計(jì)劃為當(dāng)前針對(duì)中國(guó)倉(cāng)鼠細(xì)胞培養(yǎng)物開(kāi)展研究奠定了基礎(chǔ)，大大提升了比勒菲爾德大學(xué)的地位。維也納國(guó)家資源和生命科學(xué)大學(xué)、澳大利亞工業(yè)生物技術(shù)中心已同意開(kāi)展進(jìn)一步的研究項(xiàng)目。這將讓比勒菲爾德大學(xué)處于極好的位置，為這一激烈競(jìng)爭(zhēng)的研究領(lǐng)域繼續(xù)做出貢獻(xiàn)。
