醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)教案
第 1 次課 授課時(shí)間:2009年8月31日-9月4日
課程名稱 | 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué) | 年級(jí) | 2007 | 專業(yè)、層次 | 臨床醫(yī)學(xué) | |||||||
授課教師 | 于海清 | 職稱 | 講師 | 課型(大、小) | 大 | 學(xué)時(shí) | 3 | |||||
授課題目(章、節(jié)) | 緒論、第一章 基因的結(jié)構(gòu)與功能 | |||||||||||
基本教材及主要參考書(shū) | 藥立波 主編. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)(第3版). 北京: 人民衛(wèi)生出版社, 2008 馮作化 主編. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué). 北京: 人民衛(wèi)生出版社, 2001 | |||||||||||
教學(xué)目的與要求: 目的:理解醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)的發(fā)展歷史和主要研究?jī)?nèi)容。理解和掌握基因的現(xiàn)代分子生物學(xué)概念。理解和掌握真核生物結(jié)構(gòu)基因的特點(diǎn)。理解和掌握原核生物和真核生物基因的調(diào)控序列。 要求: 1. 掌握基因的現(xiàn)代分子生物學(xué)概念。掌握DNA和RNA的化學(xué)組成;DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu);DNA的主要二級(jí)結(jié)構(gòu)。熟悉DNA的細(xì)胞內(nèi)組裝。 2. 掌握結(jié)構(gòu)基因、斷裂基因、外顯子和內(nèi)含子的概念;真核生物結(jié)構(gòu)基因的特點(diǎn);順式作用元件和反式作用因子的概念;原核生物基因的調(diào)控序列;真核生物基因的調(diào)控序列。熟悉原核生物啟動(dòng)子的功能區(qū)。 3. 掌握信使RNA的結(jié)構(gòu)特征;轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的結(jié)構(gòu)特征。熟悉核糖體RNA的功能;小分子RNA的種類和功能。 4. 掌握核酸酶的概念;核酶的概念。熟悉核酸酶的類型和特點(diǎn)。 | ||||||||||||
教學(xué)內(nèi)容與時(shí)間安排、教學(xué)方法: 內(nèi)容: 1. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)的定義、發(fā)展歷史和主要研究?jī)?nèi)容、 現(xiàn)狀和未來(lái) 10分鐘 2. 基因的研究簡(jiǎn)史和基因的現(xiàn)代分子生物學(xué)概念 25分鐘 3. 基因的化學(xué)結(jié)構(gòu) 5分鐘 4. 結(jié)構(gòu)基因?yàn)槎嚯逆満吞囟≧NA分子編碼 20分鐘 5. 基因包含結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控序列 40分鐘 6. RNA的結(jié)構(gòu)與功能 10分鐘 7. 核酸酶 10分鐘 方法:舉例調(diào)動(dòng)學(xué)生對(duì)此門課程的興趣,強(qiáng)調(diào)課程的重要性。盡量使用圖片簡(jiǎn)圖加深感性認(rèn)識(shí),總結(jié)對(duì)比增強(qiáng)辨識(shí)力,動(dòng)畫(huà)演示有助于理解。布置一些內(nèi)容自學(xué),嘗試課堂提問(wèn)或討論。 | ||||||||||||
教學(xué)重點(diǎn)及如何突出重點(diǎn)、難點(diǎn)及如何突破難點(diǎn): 重點(diǎn):基因的概念;真核生物結(jié)構(gòu)基因的特點(diǎn);原核生物基因的調(diào)控序列;真核生物基因的調(diào)控序列。對(duì)于重點(diǎn)內(nèi)容,教學(xué)過(guò)程中應(yīng)注意著重強(qiáng)調(diào),以提醒學(xué)生注意。 難點(diǎn):真核生物結(jié)構(gòu)基因的特點(diǎn);原核生物基因的調(diào)控序列;真核生物基因的調(diào)控序列。 有關(guān)基因的結(jié)構(gòu)和調(diào)控序列等教學(xué)內(nèi)容較為繁雜,應(yīng)多使用圖片和動(dòng)畫(huà)以助學(xué)生理解。 | ||||||||||||
教研室審閱意見(jiàn): 教研室主任簽名: 年 月 日 | ||||||||||||
基本內(nèi)容 | 教學(xué)手段 | 課堂設(shè)計(jì)和時(shí)間安排 | ||||||||||
緒論 1. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)的基本含義,是一門從分子水平上研究生命本質(zhì)的一門新興邊緣學(xué)科。 2. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)研究的主要內(nèi)容:基因的結(jié)構(gòu)與功能,基因組的結(jié)構(gòu)與功能,基因信息的貯存、復(fù)制、傳遞,基因表達(dá)調(diào)控,基因組學(xué)及相關(guān)組學(xué),基因變異與疾病,基因操作技術(shù)及其應(yīng)用,基因診斷,基因治療。 3. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)的發(fā)展史:萌芽階段、起步階段、發(fā)展階段。 4. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)的現(xiàn)狀與未來(lái)。 | 舉例 簡(jiǎn)圖 討論 | 舉例結(jié)合圖示講解課程概況,引起對(duì)課程的興趣,強(qiáng)調(diào)學(xué)習(xí)此課程的重要性。 (10分鐘)
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第一章 基因的結(jié)構(gòu)與功能 ―――――――――――――――――― | (★-重點(diǎn),☆-難點(diǎn))
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基因的研究簡(jiǎn)史和現(xiàn)代分子生物學(xué)概念 • 1865年,Mendel :hereditary factor • 1869年,Miescher在研究細(xì)胞核時(shí)發(fā)現(xiàn)了DNA,隨后,RNA也被發(fā)現(xiàn)。 The word protein was first used in 1838. • 1879年,F(xiàn)lemming研究細(xì)胞分裂--染色體。 • 1903年,Sutton和Boveri:factor--chromosome • 1909年,Johansen: gene (birth) • 1926年,Morgan: line, smallest unit of mutation • 1928年,Griffith: Griffith riddle (R+S) • 1941年,Beadle和Tatum: one gene, one enzyme • 1944年,Avery: gene--DNA • 1949年,Pauling: gene--amino acid sequences • 1950年,McClintock:gene is jumping! C-Ds-Ac operate system, 轉(zhuǎn)座因子, • 1952年,Hershey和Chase: gene--DNA (Herriott hypothesis) • 1953年4月25日,Watson和Crick: DNA double helix • 1956年,Kornberg: DNA聚合酶 • 1956年,Ingram: 珠蛋白第6位氨基酸殘基由Glu突變?yōu)閂al是鐮刀狀紅細(xì)胞貧血的致病原因。 • 1957年,Benzer:順?lè)醋覥istro • 1958年,Weiss: RNA聚合酶 • 1958年,Crick: Central dogma semiconservative replication • 1958年,Meselson和Stahl: 證明DNA半保留復(fù)制 • 1959年,Lejeune: Down氏綜合征是由于21號(hào)染色體三體突變所致。 • 1960年,Kendrew等完成了抹香鯨血紅蛋白三維結(jié)構(gòu)的高分辨X-射線衍射分析。 • 1960年,Hirs,Moore和Stein: RNase的一級(jí)結(jié)構(gòu) • 1961年,Jacob和Monod:operon theory,mRNA Some genes are nothing but operating! • 1964年,Nirenberg和Khorana:the Genetic Code • 1965年,中國(guó)科學(xué)家人工合成了牛胰島素。 • 1967年,Weiss發(fā)現(xiàn)了T4噬菌體DNA連接酶。 • 1968年,Okazaki提出DNA不連續(xù)復(fù)制學(xué)說(shuō)。 • 1970年,Temin和Baltimore發(fā)現(xiàn)了逆轉(zhuǎn)錄酶。 • 1972年,Berg將病毒SV40的DNA與噬菌體P22的DNA在體外重組成功。 • 1973年,Kim用X-射線衍射法測(cè)定了酵母苯丙氨酸t(yī)RNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)。 • 1973年,中國(guó)科學(xué)家用X-射線衍射法測(cè)定了牛胰島素的空間結(jié)構(gòu)。 • 1975年,Sanger建立DNA序列測(cè)定的加減法。 • 1976年,Mexam和Gilbert建立了DNA序列測(cè)定的化學(xué)法。 • 1976年,Varmus 和Bishop:病毒癌基因v-src,隨后又提出了癌基因假說(shuō)。 • 1977年,Sanger:DNA序列測(cè)定的末端終止法。 • 1977年,Sanger:基因具有重疊性。 • 1977年,Boyer將生長(zhǎng)激素釋放抑制因子基因在E. coli中表達(dá)成功。 • 1977年,Roberts和Sharp:真核基因具有內(nèi)含子和外顯子,提出了斷裂基因的概念。 • 1978年,Kan YM第一次利用DNA多態(tài)性與致病基因的關(guān)聯(lián)性成功地對(duì)鐮刀狀紅細(xì)胞貧血進(jìn)行了產(chǎn)前診斷。 • 1981年,Costantini和Lacy首次報(bào)告轉(zhuǎn)基因小鼠獲得成功。 • 1982年,Cech發(fā)現(xiàn)了四膜蟲(chóng)RNA具有自催化活性,并提出了核酶(ribozyme)的概念。 • 1983年,Mullis建立了PCR技術(shù)。 • 1983年,第一次將亨丁頓病的致病基因定位于第4號(hào)染色體上。 • 1986年,第一個(gè)人類致病基因—慢性肉芽腫病的致病基因被定位和克隆。 • 1987年,美國(guó)開(kāi)發(fā)完成DNA自動(dòng)測(cè)序儀。 • 1990年,Blaese等完成了首例針對(duì)腺苷脫氨酶缺陷基因的基因治療。 • 1990年,人類基因組計(jì)劃啟動(dòng),并于2006年完成了人類基因組DNA的全部測(cè)序工作。 • 1990~2000年,完成了多種致病微生物基因組的測(cè)序工作,其中包括流感病毒基因組、支原體基因組、結(jié)核桿菌基因組等。 • 1998年,F(xiàn)ire和Mello:RNA interference 闡明gene silencing的機(jī)制,RNAi已被廣泛用作研究基因功能的一種手段,有望在未來(lái)幫助科學(xué)家開(kāi)發(fā)出治療疾病的新療法。 基因(gene)是指核酸分子中貯存與表達(dá)遺傳信息的單位,包括編碼序列、非編碼序列和調(diào)控序列。大部分生物中構(gòu)成基因的核酸物質(zhì)是DNA,少數(shù)生物(如RNA病毒)中是RNA。 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | ★ 概念。 舉例結(jié)合圖示講解基因,進(jìn)一步引起對(duì)學(xué)生對(duì)課程的興趣 (25分鐘)
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第一節(jié) 基因的化學(xué)結(jié)構(gòu) 1. DNA和RNA的化學(xué)組成 核苷酸:戊糖、堿基(嘌呤和嘧啶)、磷酸 2. DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu):堿基組成 3. DNA的主要二級(jí)結(jié)構(gòu):雙螺旋 4. DNA在細(xì)胞內(nèi)的組裝:核小體 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | 結(jié)合圖示和復(fù)習(xí)生化相關(guān)內(nèi)容講解:DNA和RNA的化學(xué)組成;DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu);DNA的主要二級(jí)結(jié)構(gòu);DNA在細(xì)胞內(nèi)的組裝。 (5分鐘) ――第1節(jié)課結(jié)束――
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第二節(jié) 基因的功能和組構(gòu) 1. 結(jié)構(gòu)基因?yàn)槎嚯逆満吞囟≧NA分子編碼。 定義: 在基因片段中,貯存一特定轉(zhuǎn)錄RNA分子的DNA序列,這段序列決定該RNA分子的一級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)基因又稱為編碼序列。 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | ★ 結(jié)構(gòu)基因的概念。 結(jié)合圖示講解:真核生物結(jié)構(gòu)基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。 (20分鐘)
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設(shè)問(wèn) | 1. 原核生物結(jié)構(gòu)基因與真核生物結(jié)構(gòu)基因有何區(qū)別? 2. 病毒結(jié)構(gòu)基因與真核生物結(jié)構(gòu)基因有何區(qū)別?
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2. 基因包含結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控序列。 基因的組成:一個(gè)編碼特定多肽鏈的DNA序列(結(jié)構(gòu)基因) + 與蛋白質(zhì)編碼無(wú)關(guān)的DNA序列(調(diào)控序列) 原核生物基因的調(diào)控序列: 1. 啟動(dòng)子(promoter):是RNA聚合酶特異性識(shí)別和結(jié)合的DNA序列。位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動(dòng)子本身并不被轉(zhuǎn)錄。包括三個(gè)部分:轉(zhuǎn)錄起始部位(+1 bp)、-10 bp區(qū)和-35 bp區(qū)。RNA聚合酶全酶中的σ因子識(shí)別并結(jié)合在-35 bp區(qū)和-10 bp區(qū) | 討論 對(duì)比 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | ★強(qiáng)調(diào):原核生物基因的調(diào)控序列。 ☆結(jié)合圖示講解:原核生物基因的啟動(dòng)子特點(diǎn),終止子,操縱元件,正調(diào)控蛋白結(jié)合位點(diǎn)。 (20分鐘)
――第2節(jié)課結(jié)束――
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真核生物基因的調(diào)控序列 外顯子(exon) 指結(jié)構(gòu)基因中與成熟RNA分子中的保留序列相 對(duì)應(yīng)的序列 內(nèi)含子(intron) 指與RNA分子剪接時(shí)刪除部分相對(duì)應(yīng)的結(jié)構(gòu)基因序列 n 內(nèi)含子Chambon規(guī)則(GT-AG規(guī)則):5’GT-AG3’是真核chrDNA剪接酶的識(shí)別信號(hào) n GC島(GC island):人類DNA中有基因密集的“城市中心”,GC含量很高 n 與轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)的DNA序列稱為順式作用元件(cis-acting elements) n 順式作用元件:包括啟動(dòng)子、上游啟動(dòng)子元件、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)和一些反應(yīng)元件等。 1. 啟動(dòng)子 • RNA聚合酶特異性識(shí)別和結(jié)合的DNA序列。 • 多數(shù)位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動(dòng)子本身不被轉(zhuǎn)錄。但有一些啟動(dòng)子(如tRNA啟動(dòng)子)可以位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的下游,這些DNA序列可以被轉(zhuǎn)錄。 2. 上游啟動(dòng)子元件 • 指TATA盒上游的一些特定的DNA序列 • 與 TATA盒共同組成啟動(dòng)子 • 是反式作用因子(轉(zhuǎn)錄激活蛋白)識(shí)別與結(jié)合的位點(diǎn) n 常見(jiàn)的上游啟動(dòng)子元件 • CAAT盒:含有5‘GGNCAATCT3’核心序列 -80 bp~-90 bp • CACA盒: 含有5‘GCCACACCC3’核心序列-80 bp~-90 bp (大多數(shù)真核生物基因具有) • GC盒: 含有5‘CCGCC 3’ 核心序列 -70 bp和-120 bp (組成型基因具有) 3. 反應(yīng)元件 • 一類能介導(dǎo)基因?qū)?xì)胞外的某種信號(hào)產(chǎn)生反應(yīng)的特異的DNA序列 • 特點(diǎn): 具有較短的保守序列 通常位于啟動(dòng)子附近、啟動(dòng)子內(nèi)或增強(qiáng)子區(qū)域 4. poly(A)信號(hào) • II類基因除了調(diào)控轉(zhuǎn)錄起始的序列外,在結(jié)構(gòu) 基因的3‘端下游還有加尾信號(hào)。由AATAAA序列和醫(yī)學(xué).全在線52667788.cnGT豐富區(qū),或T豐富區(qū)組成。 • 作用: 終止mRNA轉(zhuǎn)錄和為其加上poly(A)尾 | 討論 對(duì)比 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | ★強(qiáng)調(diào):真核生物基因的調(diào)控序列。 ☆結(jié)合圖示講解:真核生物基因的啟動(dòng)子特點(diǎn),增強(qiáng)子,沉默子。 (20分鐘)
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第三節(jié) RNA的結(jié)構(gòu)與功能
1. 信使RNA具有特征結(jié)構(gòu)。 u 原核生物mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):多順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu) u 真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn): ① 單順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu),只編碼一條多肽鏈 ② 3’-端具有polyA的”tail“結(jié)構(gòu),不由DNA編碼,防止mRNA被核酸酶水解,核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān) ③ 5’端具有 m7G5’pppN的“cap”結(jié)構(gòu), 防止核酸外切酶對(duì)mRNA的降解,識(shí)別起始點(diǎn)(核糖體識(shí)別mRNA ) | 討論 對(duì)比 | ☆結(jié)合圖示講解:原核生物與真核生物mRNA的特征結(jié)構(gòu)。 (8分鐘)
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2. 轉(zhuǎn)運(yùn)RNA有氨基酸接納莖和反密碼環(huán)。 u 分子量25KD左右,沉降系數(shù)4s;多數(shù)為70~90個(gè)核苷酸 u 三葉草形結(jié)構(gòu) u 3’末端(接受末端)CAOH結(jié)構(gòu),接受活化的aa u 5’端多為pG,也有pC結(jié)構(gòu)的 u 執(zhí)業(yè)藥師具有不等的稀有堿基及位置不變的恒定核苷酸2 3. 核糖體RNA是核糖體的組成成分。 u 原核生物的rRNA:16S、5S、23S u 真核生物的rRNA:18S、5S、5.8S、28S 4. 小分子RNA有不同的種類和功能。 u 真核細(xì)胞的小分子RNA snRNA 參與mRNA的剪接 snoRNA參與rRNA前體的剪接 scRNA參與蛋白質(zhì)的翻譯和轉(zhuǎn)運(yùn) miRNA、siRNA、antisense RNA參與基因表達(dá)調(diào)控 u 原核細(xì)胞的小分子RNA:antisense RNA | 討論 對(duì)比 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | 結(jié)合圖示和復(fù)習(xí)生化相關(guān)內(nèi)容講解:DNA和RNA的化學(xué)組成;DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu);DNA的主要二級(jí)結(jié)構(gòu);DNA在細(xì)胞內(nèi)的組裝。 (5分鐘)
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第四節(jié) 核酸酶 核酸酶是指所有可以水解核酸的酶
• DNA酶(deoxyribonuclease,DNase),專一切割DNA • RNA酶(ribonuclease,RNase),專一切割RNA 2. 依據(jù)切割部位不同 • 核酸內(nèi)切酶 限制性核酸內(nèi)切酶 非限制性核酸內(nèi)切酶 • 核酸外切酶 5’--3’或3‘--5’核酸外切酶 ² 參與DNA的合成與修復(fù)及RNA合成后的剪接等重要基因復(fù)制和基因表達(dá)過(guò)程 ² 負(fù)責(zé)清除多余的,結(jié)構(gòu)和功能異常的核酸,同時(shí)也可以清除侵入細(xì)胞的外源性核酸 ² 消化液中降解食物中的核酸以利吸收 ² 體外重組DNA技術(shù)中的重要工具酶 核酶(ribozyme):是一類具有催化活力的RNA l 功能 主要參與RNA的加工和成熟 l 應(yīng)用 剪切、破壞特定的RNA分子,如切割RNA的基因組或癌基因的mRNA等,達(dá)到治療疾病的目的 | 討論 簡(jiǎn)圖 動(dòng)畫(huà) | ★強(qiáng)調(diào):核酸酶,核酶的概念。 ☆結(jié)合圖示講解:核酸酶的種類和特點(diǎn)。 (7分鐘)
――第3節(jié)課結(jié)束――
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小 結(jié) |
原核生物基因與真核生物基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。 原核生物基因與真核生物基因的調(diào)控序列。 (2分鐘)
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復(fù) 習(xí) 思 考 題 、 作 業(yè) 題 | 1. 什么是DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)? 2. DNA的主要二級(jí)結(jié)構(gòu)的要點(diǎn)有哪些? 3. 什么是Chargaff規(guī)則? 4. 原核生物與真核生物DNA的細(xì)胞內(nèi)組裝有何不同? 5. 原核生物的結(jié)構(gòu)基因與調(diào)控序列是怎樣進(jìn)行組織的? 6. 真核生物的順式作用元件包括哪些? 7. 什么是啟動(dòng)子、增強(qiáng)子和沉默子? 8. 真核生物信使RNA有何結(jié)構(gòu)特征? 9. 原核生物和真核生物核蛋白體的組成有何不同? 10. 小分子RNA的種類和功能有哪些? 11. 核酸酶的類型有哪些,各有什么特點(diǎn)? 12. 核酶的本質(zhì)和功能是什么?
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下 次 課 預(yù) 習(xí) 要 點(diǎn) | 1. 真核細(xì)胞基因組存在三種重復(fù)序列 2. 多基因家族及假基因的概念; 3. 原核生物基因組的特點(diǎn) 4. 操縱子的概念。 5. 病毒基因組的分類和特點(diǎn) 6. 重疊基因的概念。
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實(shí) 施 情 況 及 分 析 |
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