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曲霉病的病原菌為曲霉屬的一些種。中國真菌志第5卷列有我國曲霉屬14個組的89個種和變種，其中部分為病原菌。煙曲霉是最常見的病原菌，可引起所有的過敏性和感染性曲霉病。
僅有無性期的曲霉屬半知菌亞門-絲孢菌綱-絲孢菌目-叢梗孢科。有些種具有性期，屬子囊菌亞門-不整子囊菌綱-散囊菌目-散囊菌科，主要為散囊菌屬、新薩托菌屬、裸殼孢屬和石座菌屬等。具有性期的曲霉能產(chǎn)生閉囊殼，為封閉式的薄壁子囊果，內含子囊和子囊孢子。
曲霉屬具有特征性的結構，為分生孢子頭和足細胞（稱分生孢子梗)，分生孢子頭包括分生孢梗、頂囊、瓶梗、�；头稚咦渔�。頂囊為分生孢子梗頂部的可孕性膨大。表面只有瓶梗稱單層小梗，為產(chǎn)孢細胞。
同時有瓶梗和�；Q雙層小梗。有些種則既有單層，也有雙層，甚至同一頂囊上兩者兼而有之。足細胞為特化的厚壁膨大的菌絲細胞。一側垂直向上延長形成分生孢子孢梗莖，簡稱孢梗莖。
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