三、應(yīng)用特異單引物法標(biāo)記DNA探針
應(yīng)用探針DNA上的一個(gè)片段作為DNA引物,以環(huán)化探針DNA的重組質(zhì)粒DNA為模板,在DNA聚合酶的作用下,通過(guò)變性,退火和延伸過(guò)程,使探針DNA得到標(biāo)記。反應(yīng)在0.5ml離心管內(nèi)進(jìn)行,總體積為25μl,內(nèi)含50mmol/l Tris—HCl pH7.5, 10mmol/L MgCl2、BSa 5mmol/L、80ng引物DNA和0.1μg連接的DNA或0.1μg質(zhì)粒。反應(yīng)管在95℃變性5min,取出,稍離心,立即放入37℃C水浴保溫2min使DNA退火,加入1UE.coli DNA聚合酶I,在37℃進(jìn)行延伸反應(yīng)。對(duì)環(huán)化基因,延伸18min,對(duì)質(zhì)粒DNA延伸35min重復(fù)上述變性、退火和延伸過(guò)程1次。
四、雙引物法標(biāo)記DNA探針?lè)?/P>
反應(yīng)在0.5ml管內(nèi)進(jìn)行,反應(yīng)體積為50μl,內(nèi)含50mmol/l Tris(pH7.5)、10mmol/l Mg-Cl2、10mmol/L β-巰基乙醇和500μg BSA/ml,引物片段1和2各90ng,模板DNA0.1μg,[α-32P]dCTp 1.5×106Bq,dATp 、dGTP和dTTP各200μmol/L。標(biāo)記反應(yīng)包括3個(gè)步驟:
。1)變性:反應(yīng)管在95℃水浴5min,然后離心;
。2)退火:37℃水浴2min;
。3)延伸:加入DNA聚合酶i 1u,37℃水浴18min。重復(fù)上述變性、退火、延伸過(guò)程1~2次,分別進(jìn)行其標(biāo)記率測(cè)定:取0.5μl反應(yīng)液分別點(diǎn)于兩張濾紙片上,烤干。一張經(jīng)0.6mol/L三氯醋酸(TCA)、0.3mol/l TCA依次洗滌,每次10min,然后再用無(wú)水乙醇,醇醚混合液和乙醚洗滌各5min。兩張濾紙分別放入閃爍瓶?jī)?nèi),測(cè)定cpm值,達(dá)到108cpm/μg DNA以上。
五、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)標(biāo)記高活性DNA探針
在0.5ml離心管內(nèi)進(jìn)行,反應(yīng)總體積為50μl,內(nèi)含模板DNA350ng,DNA引物各50pmol/L,dGTP、dCTP和dTTP各200μmol/L,[α-32P]dATp 1.1×106Bq,反應(yīng)緩沖液為67mmol/l Tris—HCl pH8.8含2.5mmol/l MgCl2、6.7mmol/L(NH4)2SO4、10mmol/l β-巰基乙醇、170mg/l BSA、6.7μmol/l EDTA和40μl/ml二甲亞砜。將反應(yīng)管置于95℃水浴變性5min取出,加入Taq DNA聚合酶0.5~2u,在旋渦混合器上混勻簡(jiǎn)單離心一下,加入35μl石蠟油。放入65℃水浴2min,取出,立即進(jìn)入PCR循環(huán):91℃變性30s,51。C退火1min,68℃延伸2min。重復(fù)上述過(guò)程15次。最后將反應(yīng)管置65℃水浴5min。反應(yīng)完成,加入酵母tRNA10μg。分別測(cè)定參入和游離放射性計(jì)數(shù),參入率為97.4%。標(biāo)記DNA探針經(jīng)醋酸鈉酒精沉淀回收。將沉淀溶于10mmol/l Tris—HCl 、EDTA(pH8.0)100μl。用PCR方法標(biāo)記的DNA探針特異性高,敏感性好,可測(cè)出的最低靶DNA量為10fg,利用PCR還可以作DNA探針的非放射性標(biāo)記。