生物化學(xué)是一門邊緣學(xué)科，研究的是生命的化學(xué)，所以與其它有關(guān)的生物學(xué)科必然有或多或少的關(guān)系。生物學(xué)科總是互相為用，互相滲透的。生物體不只一種，因此生物化學(xué)有研究動(dòng)物（包括昆蟲)方面的，也有研究植物方面的，還有研究微生物方面的。它們之間有差異、也有共同之處。生物化學(xué)在醫(yī)藥、衛(wèi)生、農(nóng)業(yè)及工業(yè)等方面都有應(yīng)用，是一門基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)學(xué)科，也是一門基礎(chǔ)農(nóng)學(xué)學(xué)科，而在工業(yè)上，如食品加工、釀造、制藥、生物制劑制備、以及制革等上，都有應(yīng)用。
（一)生物化學(xué)是從有機(jī)化學(xué)及生理學(xué)發(fā)展起來的
一直到現(xiàn)在，它與有機(jī)化學(xué)及生理學(xué)之間，仍然關(guān)系密切。了解生物分子的結(jié)構(gòu)及性質(zhì)，并將其合成，乃是有機(jī)化學(xué)和生物化學(xué)的共同課題；在分子水平上弄清生理功能，顯然是生理學(xué)和生物化學(xué)的一個(gè)共同目的。從現(xiàn)在的趨向來看，生理學(xué)是在更多地采用生物化學(xué)的方法，使用生物化學(xué)的指標(biāo)，以解釋許多生理現(xiàn)象。
（二)微生物學(xué)及免疫學(xué)
在研究病原微生物的代謝、病毒的化學(xué)本質(zhì)，以及防治措施等，無不應(yīng)用生物化學(xué)的知識(shí)和技術(shù)。就免疫學(xué)而言，不論是體液免疫，還是細(xì)胞免疫，都必須在分子水平上，才能闡明機(jī)理問題，近來一些生物化學(xué)家常以微生物，尤其是細(xì)菌為研究材料；這樣，一方面可驗(yàn)證在動(dòng)物體內(nèi)得到的結(jié)果，另一方面由于細(xì)菌繁殖生長(zhǎng)極其迅速，為在分子水平上研究遺傳，提供有利條件；于是應(yīng)運(yùn)而生出生化遺傳學(xué)，又稱分子遺傳學(xué)，進(jìn)而又派生出遺傳工程學(xué)。由此不難看出，生物化學(xué)與微生物學(xué)、免疫學(xué)及遺傳學(xué)之間的關(guān)系是何等密切。
（三)生物物理學(xué)是從生物化學(xué)發(fā)展起來的
主要應(yīng)用物理學(xué)的理論和方法來研究生物體內(nèi)各種生物分子的性質(zhì)和結(jié)構(gòu)，能量的轉(zhuǎn)變，以及生物體內(nèi)發(fā)生的一些過程，如生物發(fā)電及發(fā)光。生物物理學(xué)與生物化學(xué)總是相輔相成的。隨著量子化學(xué)的發(fā)展，生物體內(nèi)化學(xué)反應(yīng)的機(jī)理，特別是酶促反應(yīng)的機(jī)理，將來必定要應(yīng)用生物分子內(nèi)及作用物分子內(nèi)電子結(jié)構(gòu)的改變來加以說明。
（四)近代藥理學(xué)往往以酶的活性、激素的作用及代謝的途徑等為其發(fā)展的依據(jù)，于是出現(xiàn)了生化藥理學(xué)及分子藥理學(xué)等。病理生理學(xué)也注重運(yùn)用生物化學(xué)的原理及方法來研究生理功能的失調(diào)及代謝途徑的紊亂。甚至，組織學(xué)、病理解剖學(xué)及寄生蟲學(xué)等學(xué)科，也開始應(yīng)用生物化學(xué)的知識(shí)和方法，以探討和解決它們的問題。這些學(xué)科的名稱之前，現(xiàn)在多冠以“分子”字樣，就是這方面的一個(gè)證明。
（五)生物化學(xué)稱為醫(yī)學(xué)學(xué)科的基礎(chǔ)，在醫(yī)藥衛(wèi)生的各學(xué)科中廣泛應(yīng)用，是理所當(dāng)然的。事實(shí)也是如此。臨床醫(yī)學(xué)及衛(wèi)生保健，在分子水平上，探討病因，作出論斷，尋求防治，增進(jìn)健康，莫不運(yùn)用生物化學(xué)的知識(shí)和技術(shù)。鐮狀細(xì)胞性貧血已被證明是血紅蛋白β鏈N未端第六位上的谷氨酸為纈氨酸所取代的結(jié)果。關(guān)于許多疾病的防治方面，免疫化學(xué)無疑是醫(yī)務(wù)工作者所熟知的一種重要的預(yù)防、治療及診斷手段。腫瘤的治療，不論是放射療法，抑或是化學(xué)療法，都是使腫瘤細(xì)胞中重要的生物分子，如DNA、RNA、蛋白質(zhì)等分子，改變或破壞其結(jié)構(gòu)，或抑制其生物合成。放射療法主要是對(duì)DNA起作用。而抗腫瘤藥物，如抗代謝物、烷化劑、有絲分裂抑制劑及抗生素等，有的在DNA生物合成中起作用，有的在RNA生物合成中起作用，還有的在蛋白質(zhì)生物合成中起作用，當(dāng)然不能除外有的藥物能抑制不只一種生物合成過程。只要這三種生物分子中任何一種的生物合成有阻礙，都會(huì)使腫瘤細(xì)胞遭到不同程度的打擊，其最致命的要算是破壞DNA的生物合成了，至于用生物化學(xué)的方法及指標(biāo)作為診斷的手段，最為人們所熟知的莫若肝炎診斷中的血液谷丙轉(zhuǎn)氨酶了�？傊�，生物化學(xué)在臨床醫(yī)學(xué)及衛(wèi)生保建上的應(yīng)用的例子是很多的。
