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生物化學(xué)與分子生物學(xué)-實驗指導(dǎo):實驗十二 組織細胞基因組DNA的提取

生物化學(xué)與分子生物學(xué):實驗指導(dǎo) 實驗十二 組織細胞基因組DNA的提取:實驗十二組織細胞基因組DNA的提取【實驗?zāi)康摹可锛毎鸇NA提取方法較多,本實驗熟悉生物細胞DNA提取方法的一種;掌握SDS使蛋白質(zhì)變性而與DNA分離進行提取DNA的基本原理;熟悉SDS法提取DNA的基本操作過程!緦嶒炘怼可锝M織中DNA是以DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的形式存在。在稀NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度小,RNA-蛋白質(zhì)溶解度大;在濃NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度大,RNA-蛋

實驗十二 組織細胞基因組DNA的提取

【實驗?zāi)康摹?/p>

生物細胞DNA提取方法較多,本實驗熟悉生物細胞DNA提取方法的一種;掌握SDS使蛋白質(zhì)變性而與DNA分離進行提取DNA的基本原理;熟悉SDS法提取DNA的基本操作過程。

【實驗原理】

生物組織中DNA是以DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的形式存在。在稀NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度小,RNA-蛋白質(zhì)溶解度大;在濃NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度大,RNA-蛋白質(zhì)溶解度;據(jù)此可分開DNA和RNA。

SDS(十二烷基硫酸鈉),是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開,并結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水部位,引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變,使蛋白質(zhì)變性并與DNA分離;SDS也是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負電。

氯仿-異丙醇可以將蛋白質(zhì)除去,離心后形成三層,上層為DNA、異丙醇和水;中層為蛋白質(zhì)沉淀;下層為氯仿。適量的冷無水乙醇可使DNA沉淀析出。加入EDTA - 2Na(乙二胺四乙酸二鈉)可防止DNA酶的降解。

A260/A280比值可用于檢查DNA純度:A260/A280 =1.8,高純度DNA;A260/A280< 1.8,含蛋白質(zhì); A260/A280> 1.8,含RNA。

【實驗試劑和器材】

1. 試劑

⑴ 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA。

⑵ 5 mol/L NaCl。

⑶ 30% SDS。

⑷ 氯仿-異丙醇混合液。

⑸ 0.015mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉。

⑹ 冷無水乙醇。

2. 器材

⑴ 低速離心機。

⑵ 鑷子。

⑶ 剪刀。

⑷ 三角燒瓶。

【實驗步驟】

1. 提取脫氧核糖核蛋白

⑴ 取肝3克(2~3只小鼠),15 mL 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA洗去血液。

⑵肝勻漿制備:將兔肝置乳缽中剪碎,加15 mL 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA研磨勻漿,注意不要用力研磨。

⑶ 3000 rpm離心10分鐘,棄上清;沉淀加入0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA 15 mL輕輕混懸。

⑷ 3000 rpm離心 10分鐘,棄上清;沉淀加入0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA 10 mL 使之溶解,轉(zhuǎn)至50毫升三角燒瓶中。

2. 去除蛋白質(zhì)

⑴ 加入30% SDS 1 mL 混勻,60℃水浴輕搖15分鐘,取出冷至室溫。

⑵加入5 mol/L NaCl2.75 mL,輕搖10分鐘。

⑶加入氯仿-異丙醇19 mL(沉淀蛋白),輕搖20分鐘,離心 25052667788.cn/sanji/0rpm10分鐘。

3. 提取DNA

⑴ 吸上清(水相)轉(zhuǎn)入玻璃離心管(含DNA),棄沉淀(剩余物)。

⑵加入1.5倍體積冰乙醇(無水乙醇)輕搖至DNA析出。

4. 檢測

⑴ 用鑷子或玻璃棒取出置試管中,加入0.015 mol/LNaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉1mL。

⑵ 量取10~50 μL(用0.1 mL刻度吸管吸取) 原液,用0.015mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉稀釋到5 mL(稀釋100~500倍)。

⑶ 測A260/A280(用0.015 mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉做空白溶液)。

5. 計算

⑴ DNA濃度:(μg/mL)=A260×50×稀釋倍數(shù)

⑵ DNA純度:A260/A280

【實驗注意事項】

1.為盡可能避免DNA 大分子的斷裂,在實驗過程中必須注意:① 研磨時上下用力,應(yīng)保持低溫,研磨時間應(yīng)短,勿用玻璃勻漿器。② 實驗中使用的吸取DNA 水溶液的滴管管口需粗而短,并燒成鈍口。③ 抽提時勿劇烈振搖。

2.保醫(yī)學(xué)全.在線持DNA 活性,避免酸、堿或其它變性因素使DNA 變性。

3.加入氯仿—異丙醇后勿劇烈搖動,以免大分子斷裂。

4.有機溶劑對人體有害,操作時要注意。

【思考題】

1.如樣品中有蛋白質(zhì)存在,其紫外分析結(jié)果有何表現(xiàn)?如何進一步純化?

2.DNA 的定量可采用那些方法?目前常用的是哪種?如何測定DNA 的含量?

3.從生物細胞中提取DNA 的主要注意點是什么?應(yīng)如何控制?

4.能引起DNA 變性的因素有哪些?DNA 降解和DNA 變性有何區(qū)別?如何鑒別?

 

 

 

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