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實驗十二 組織細胞基因組DNA的提取 |
【實驗?zāi)康摹?/p> 生物細胞DNA提取方法較多,本實驗熟悉生物細胞DNA提取方法的一種;掌握SDS使蛋白質(zhì)變性而與DNA分離進行提取DNA的基本原理;熟悉SDS法提取DNA的基本操作過程。 【實驗原理】 生物組織中DNA是以DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的形式存在。在稀NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度小,RNA-蛋白質(zhì)溶解度大;在濃NaCl溶液中,DNA-蛋白質(zhì)溶解度大,RNA-蛋白質(zhì)溶解度;據(jù)此可分開DNA和RNA。 SDS(十二烷基硫酸鈉),是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開,并結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水部位,引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變,使蛋白質(zhì)變性并與DNA分離;SDS也是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負電。 氯仿-異丙醇可以將蛋白質(zhì)除去,離心后形成三層,上層為DNA、異丙醇和水;中層為蛋白質(zhì)沉淀;下層為氯仿。適量的冷無水乙醇可使DNA沉淀析出。加入EDTA - 2Na(乙二胺四乙酸二鈉)可防止DNA酶的降解。 A260/A280比值可用于檢查DNA純度:A260/A280 =1.8,高純度DNA;A260/A280< 1.8,含蛋白質(zhì); A260/A280> 1.8,含RNA。 【實驗試劑和器材】 1. 試劑 ⑴ 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA。 ⑵ 5 mol/L NaCl。 ⑶ 30% SDS。 ⑷ 氯仿-異丙醇混合液。 ⑸ 0.015mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉。 ⑹ 冷無水乙醇。 2. 器材 ⑴ 低速離心機。 ⑵ 鑷子。 ⑶ 剪刀。 ⑷ 三角燒瓶。 【實驗步驟】 1. 提取脫氧核糖核蛋白 ⑴ 取兔肝3克(2~3只小鼠),15 mL 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA洗去血液。 ⑵肝勻漿制備:將兔肝置乳缽中剪碎,加15 mL 0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA研磨勻漿,注意不要用力研磨。 ⑶ 3000 rpm離心10分鐘,棄上清;沉淀加入0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA 15 mL輕輕混懸。 ⑷ 3000 rpm離心 10分鐘,棄上清;沉淀加入0.14 mol/L NaCl,0.1 mol/L EDTA 10 mL 使之溶解,轉(zhuǎn)至50毫升三角燒瓶中。 2. 去除蛋白質(zhì) ⑴ 加入30% SDS 1 mL 混勻,60℃水浴輕搖15分鐘,取出冷至室溫。 ⑵加入5 mol/L NaCl2.75 mL,輕搖10分鐘。 ⑶加入氯仿-異丙醇19 mL(沉淀蛋白),輕搖20分鐘,離心 25052667788.cn/sanji/0rpm10分鐘。 3. 提取DNA ⑴ 吸上清(水相)轉(zhuǎn)入玻璃離心管(含DNA),棄沉淀(剩余物)。 ⑵加入1.5倍體積冰乙醇(無水乙醇)輕搖至DNA析出。 4. 檢測 ⑴ 用鑷子或玻璃棒取出置試管中,加入0.015 mol/LNaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉1mL。 ⑵ 量取10~50 μL(用0.1 mL刻度吸管吸取) 原液,用0.015mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉稀釋到5 mL(稀釋100~500倍)。 ⑶ 測A260/A280(用0.015 mol/L NaCl-0.0015 mol/L檸檬酸鈉做空白溶液)。 5. 計算 ⑴ DNA濃度:(μg/mL)=A260×50×稀釋倍數(shù) ⑵ DNA純度:A260/A280 【實驗注意事項】 1.為盡可能避免DNA 大分子的斷裂,在實驗過程中必須注意:① 研磨時上下用力,應(yīng)保持低溫,研磨時間應(yīng)短,勿用玻璃勻漿器。② 實驗中使用的吸取DNA 水溶液的滴管管口需粗而短,并燒成鈍口。③ 抽提時勿劇烈振搖。 2.保醫(yī)學(xué)全.在線持DNA 活性,避免酸、堿或其它變性因素使DNA 變性。 3.加入氯仿—異丙醇后勿劇烈搖動,以免大分子斷裂。 4.有機溶劑對人體有害,操作時要注意。 【思考題】 1.如樣品中有蛋白質(zhì)存在,其紫外分析結(jié)果有何表現(xiàn)?如何進一步純化? 2.DNA 的定量可采用那些方法?目前常用的是哪種?如何測定DNA 的含量? 3.從生物細胞中提取DNA 的主要注意點是什么?應(yīng)如何控制? 4.能引起DNA 變性的因素有哪些?DNA 降解和DNA 變性有何區(qū)別?如何鑒別?
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