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DNA重組實(shí)驗(yàn)中常用的技術(shù)

 

 。ǘ)試劑盒成份

  1.無標(biāo)記對(duì)照DNA1 此管內(nèi)有20μl pBR328 DNA100μg/ml,pBR328分別用BamHⅠ,BglⅠt HinfⅠ消化,它們的混合比例為2:3:3,共有16個(gè)Pbr328片段,這些片段的大小分別為:4907,2176,1766,1230,1033,653,517,453,298,234,234,220和154×2bp。

  2.無標(biāo)記對(duì)照DNA2 此管內(nèi)有20μl pBR328 DNA200μg/ml,已用EcoRⅠ線性化。

  3.DNA稀釋緩沖液 有兩管,每管1ml[成分為:Tris-HCl(10mmol/L),EDTA(1mmol/L),pH8.0(20℃)]內(nèi)含鮭魚精DNA(50μg/ml)。

  4.標(biāo)記對(duì)照DNA 此管內(nèi)有50μl線性化pBR328DNA,按標(biāo)記方法已標(biāo)記有地高辛配基dUTP,含20μg模板DNA,每毫升含5μg合成的標(biāo)記DNA。

  5.六聚核苷酸混合物

  6.標(biāo)記用混合底物 此管內(nèi)有50μl 10倍濃度的dNTP標(biāo)記用混合底物,含dATP(1mmol/L)dCTP(1mmol/L),dGTP(1mmol/L),dTTP(0.65mmol/L)和Dig-dUTP(0.35mmol/L),pH6.5(20℃)。

  7.DNA聚合酶Ⅰ大片段(標(biāo)記級(jí)) 此管內(nèi)有25μl DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow),2U/μl。

  8.(Dig)AP結(jié)合物 此管內(nèi)有200μl多克隆羊抗地高辛配基Fab-片段,結(jié)合有堿性磷酸酶750U/ml。

  9.NBT 有兩管,每管1.25ml,是溶于70%(V/V)二甲基甲酰胺的硝基藍(lán)四唑鹽溶液(75mg/ml)。

  10.X-磷酸鹽 有兩管,每管0.9ml,是溶于二甲基甲酰胺的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸鹽的甲苯胺溶液(50mg/ml)。

  11.封阻試劑 有兩瓶,每瓶有50g粉劑。

 。ㄈ)需配制的溶液

  EDTA(0.2mol/L),pH8.0 (20℃);LiCl(4mol/L);70%(V/V)乙醇;Tris-HCl(10mmol/L);ED-TA(1mmol/L),pH8.0(20℃);10%(V/V)N-十二烷基肌氨酸鈉鹽;10%(V/V)SDS;20×SSC:3mol/l NaCl;0.3mol/L檸檬酸三鈉;pH7.0 Tris-HCl(100mmol/L);NaCl(150mmol/L);pH7.5Tris –HCl(100mmol/L);NaCl(100mmol/L);MgCl2(50mmol/L)pH9.5(20℃)。

 。ㄋ)操作方法

  1.標(biāo)記DNA探針 每次標(biāo)準(zhǔn)的反應(yīng)可標(biāo)記10ng至3μg線性的DNA,也可標(biāo)記更大量的DNA,但所有的成分和體積要相應(yīng)增加。

 。1)DNA探針熱變性,煮沸10min,迅速冷卻于冰/乙醇中5min以上,待用。

  (2)取Eppendorf管(1.5ml)置于冰上,加下列及試劑:

  新鮮變性的DNA           1-3μg

  六聚核苷酸混合物         2μl(管5)

  dNTP標(biāo)記用混合底物        2μl(管6)

  加無菌重蒸水至          19μl

  DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow)   1μl(管7)

  (3)在37℃保溫至少60min,可到20h。

  (4)煮沸5min,終止反應(yīng)。

 。5)15000rpm離心30s,置于冰上待用。

  2.預(yù)雜交 按100cm2膜用20~40ml預(yù)雜交溶液,預(yù)雜交時(shí)使溶液處于流動(dòng)狀態(tài)。

  預(yù)雜交液組成:5×SSC

  0.5%(W/V)封阻試劑(管11)

  0.1%(W/V)N-十二烷酰肌氨酸鈉

  0.02%(W/V)SDS

  膜放入塑料袋,灌入預(yù)雜交液,排除氣體后密封,在65℃預(yù)雜交過夜。

  3.雜交 按100cm2膜用2.5ml雜交液,雜交時(shí)偶爾搖動(dòng)雜交袋,使里面的溶液重新分配。

  雜交液組成: 50%甲酰胺(V/V)

  5%(W/V)封阻試劑

  5×SSC

  0.1(W/V)N-十二烷酰肌氨酸鈉

  0.02%(W/V)SDS

  新變性標(biāo)記DNA(150ng/ml)

  雜交液取代預(yù)雜交液,替換間膜不能干,成功地替換應(yīng)是膜與塑料袋間形成一層雜交液膜。于42℃雜交過夜(16~20h)。

  4.洗膜  按100cm2膜用250ml洗膜液計(jì)算。

  (1)在室溫下用2×SSC/0.1%(W/V)SDS溶液漂洗,5min,2次。

 。2)在65℃條件下用0.1×SSC/0.1%SDS溶液漂洗,10min,2次。

 。3)在室溫下用2×SSC溶液漂洗1次。

  5.免疫測(cè)定

  (1)配制溶液

  緩沖液1:Tris-HCl(100mmol/L);NaCl(150mmol/L)pH7.5(20℃)

  緩沖液2:0.5%(W/V)封阻試劑(管11),配制于緩沖液1中(封阻試劑不會(huì)快速溶解,因此應(yīng)預(yù)早1h前配制此溶液,將試劑溶于50~70℃,此溶液保持混濁)。

  緩沖液3:Tris-HCI(100mmol/L);NaCI(100mmol/L);MgCI2(500mmol/L)pH9.5(20℃)。

  緩沖液4:Tris-HCl(10mmol/l);EDTA(1mmol/L);pH8.0(20℃)

  顯色溶液:新鮮配制,在10ml緩沖液3中,加45μlNBT溶液(管9)和35μlX-磷酸鹽緩沖液(管10)。

  2. 顯色過程

  A.膜在緩沖液1中短暫洗滌(1min)。

  B.在100ml緩沖2中保溫30min。

  C.再用緩沖液1短暫洗滌。

  D.用緩沖液1稀釋的抗體結(jié)合物(管8)至150U/L(1:5000);稀釋后的抗體結(jié)合物在4℃只能穩(wěn)定12h。

  E.膜在20ml稀釋的抗體結(jié)合物溶液中保溫30min。

  F.用100ml緩沖液1洗膜,以除去未結(jié)合的抗體結(jié)合物,15min,2次。

  G.膜在緩沖液3中平衡2min。

  H.在黑暗條件下,膜與10ml顯色溶液放入塑料袋內(nèi)密封或放入合適的盒子內(nèi),幾分鐘內(nèi)開始出現(xiàn)顏色,一般顯色反應(yīng)在1天后全部完成。當(dāng)顏色顯影時(shí),不可振蕩或攪拌。

  I.當(dāng)要求的點(diǎn)或帶已被檢測(cè)時(shí),可用50ml緩沖液4洗膜5min終止反應(yīng)。

  J.?dāng)z相。

  說明:上述各反應(yīng)均在室溫下進(jìn)行,除了顯色反應(yīng)外,均需振蕩或攪拌。

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