一、質(zhì)粒DNA的提取及鑒定
。ㄒ)質(zhì)粒DNA的提取及鑒定
1.收獲細(xì)菌
。1)將2ml含相應(yīng)抗生素的LB液體培養(yǎng)基加入到通氣良好的15ml的試管中,接入一單菌落,于37℃劇烈振蕩培養(yǎng)過夜。
。2)將1.5ml培養(yǎng)物倒入1.5ml離心管中,用臺式離心機于4℃以12000g離心5min,將剩余的培養(yǎng)物貯存于4℃。
。3)吸盡培養(yǎng)液,使細(xì)菌沉淀盡可能干燥。
2.堿裂解法小量抽提質(zhì)粒
。1)將細(xì)菌沉淀[上述步驟(3)所得]重懸于100μl預(yù)冷的溶液Ⅰ(50mmol/L葡萄糖,25mmol/l Tris –HCl pH8.0, 10mmol/L EDTA)中,劇烈振蕩。
。2)加200μl新配制的溶液Ⅱ(0.2mol/l NaOH, 1%SDS),緩和振蕩,水浴5min。
。3)加150μl預(yù)冷溶液Ⅲ(50mol/L KAC 60ml, 冰乙酸11.5ml,水28.5ml),緩和振蕩,冰浴5min。
。4)4℃以12000g離心5min,將上清轉(zhuǎn)移到另一離心管中。
。5)可作不可作:加等量飽和酚,氯仿,振蕩混勻,重復(fù)2,(4)。
。6)用2倍體積無水乙醇室溫沉淀雙鏈DNA,振蕩混合,于室溫放置2min。
(7)4℃以12000g離心5min。
(8)小心吸盡上清液,將離心管倒置于一張紙巾上,再將附于管壁的液滴除盡。
(9)用75%乙醇于4℃洗滌DNA,同上離心去上清真空抽干。
。10)加50μl的1×TE(含20μg/ml無DNA酶的胰RNA酶),振蕩,貯存于-20℃。
。ǘ)質(zhì)粒DNA的大量制備
。1)同上1.(1)
。2)將1ml含菌液倒入含相應(yīng)抗生素的Lb 100ml中,37℃振蕩培養(yǎng)至A590=1.0(5~6h)。
。3)加氯霉素(170μg/ml)擴增,37℃溫箱中培養(yǎng)過夜。
(4)收集菌液于離心管中,冰浴10min。3000rpm,離心10min,去上清。
(5)加溶液Ⅰ5ml懸浮菌體,將懸液倒入高速離心管中,搖勻,冰浴5min。
(6)加溶液Ⅱ10ml輕輕混勻,室溫下5min。
。7)加溶液Ⅲ7.5ml輕輕混勻,冰浴30min。15000rpm,4℃離心20min。
。8)取上清液于高速離心管中,加2倍體積的無水乙醇,混勻,入-20℃3~5h。
(9)15000rpm 4℃ 離心20min。
。10)棄上清,將離心管倒放入真空泵中抽干(10~15min)。
。11)用5ml1×TE溶解,加入RNase A 15~20μl,42℃水浴4h于過夜。
(12)加入5ml飽和酚,混勻,4000~5000rpm離心5min,取上清液入5ml離心管內(nèi)。
(13)分別加入2.5ml飽和酚,2.5ml氯仿,混勻后同樣離心收集上清。
。14)加等體積氯仿/異戊醇(24:1)混勻,同樣離心收集上清。
(15)加入1/10體積的3mol/l NaAc及2倍體積的無水乙醇于-20℃3~5h。
。16)10000rpm 4℃離心20min。
(17)棄上清,加入75%乙醇洗滌2次。
。18)離心棄上清,真空抽干,加入適量1×TE溶解質(zhì)粒DNA。
。ㄈ)質(zhì)粒DNA的鑒定
1.酶切反應(yīng)
。1)在0.5ml Eppendorf管中加重蒸水6μl,10×Buffer 1μl,DNA 2μl,酶1μl,混勻,37℃水浴1h以上。
。2)取反應(yīng)物點樣,觀察酶切效果。
。3)酶切完全后,70℃5min終止反應(yīng)。
2.瓊脂糖電泳
(1)配制所需濃度瓊脂糖凝膠。
(2)在待測的DNA樣品中加1/5體積的溴酚藍指示劑,混勻后點樣。
。3)打開電源開關(guān),5V/cm電泳。醫(yī)學(xué)全在線網(wǎng)站www.med126.com
(4)在UV燈下觀察電泳結(jié)果。
二、DNA的重組
。ㄒ)DNA的酶切與連接
。1)酶切反應(yīng)
同質(zhì)粒DNA的鑒定,只不過是質(zhì)粒DNA換為載體DNA。若大量酶切,則成比例增加。
。2)加2倍體積的預(yù)冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻,-20℃2h以上。
(3)15000rpm離心15min,棄上清。
(4)加入75%乙醇洗滌2次,離心棄上清,真空抽干。
。5)加入適量1×TE溶解。如此可得線性化載體DNA。
。6)測定DNA的含量。
(7)加入線性載體DNA和含量3~4倍于載體的待插入DNA片段,連接緩沖液及T4連接酶適量至總體積為20μl,在12~14℃反應(yīng)12~16h。
。8)連接反應(yīng)液可置-20℃保存,供轉(zhuǎn)化用。
(9)關(guān)于待插入DNA片段的獲得參見附注。